《植物生理学报》 2020, 56(3): 573-582

基于2b-RAD技术的糯玉米品种‘沪玉糯3号’特异SNP分子标记开发

卢媛^1,2 , 韩晴^1,2, 王义发¹, 施标^1,2,*, 沈雪芳^1,2,*

¹上海市农业科学院作物育种栽培研究所, 上海201403; ²CIMMYT-中国特用玉米研究中心, 上海201403

通信作者：施标；E-mail: 施标(18918162109@163.com)、沈雪芳 (shenxuefang68@163.com)

摘　要：

利用2b-RAD (type IIB endonucleases restriction-site associated DNA)技术对糯玉米品种‘沪玉糯3号’及其亲本进行简化基因组测序。通过与玉米‘B73’参考基因组序列进行比对, 在3个糯玉米样品的共同测序标签内筛选出20 498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点, 并基于RADtyping分型策略对它们进行基因型分型。对其中20 333个位于玉米10条染色体上的SNP位点的基因型进行分析, 开发出6个可用于‘沪玉糯3号’品种特异性鉴定的SNP分子标记。

关键词：糯玉米‘沪玉糯3号’; 2b-RAD; SNP; 品种特异性

收稿：2019-09-05   修定：2019-10-28

资助：上海市种业发展项目[沪农科种字(2016)第1-3号]、上海市科学技术委员会科研计划项目(153919N1300、17391900100和17391902702)、上海市农业科学院卓越团队项目(农科创2017B-08)、上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2015)第1-4号、沪农青字(2018)第1-6号]和2019上海市农业科学院青年科技人员“助跑”计划。